Organigrama del Poder Ejecutivo

Secretaría de Gobierno

• Consejo Estatal de Población

• Coordinación Estatal de Protección Civil Morelos

• Coordinación Estatal de Reinserción Social

• Secretariado Ejecutivo del Sistema Estatal de Seguridad Pública

• Instituto Estatal de Documentación de Morelos y Archivo General del Estado de Morelos

Secretaría de Obras Públicas

• Instituto Morelense de Vivienda Sustentable

Secretaría de Educación

• Coordinación Estatal del Subsistema de Preparatoria Abierta

Secretaría de Salud

• Régimen Estatal de Protección Social en Salud 

Secretaría Ejecutiva de la Gubernatura 

• Comisión de Desarrollo de Infraestructura 

• Unidad de Procesos para la Adjudicación de Contratos del Poder Ejecutivo 

• Operador de Carreteras de Cuota 

Secretaría de Desarrollo Social 

• Instituto Morelense de las Personas Adolescentes y Jóvenes (IMPAJOVEN)

• Comisión Estatal de Evaluación del Desarrollo Social

Secretaría del Trabajo

• Tribunal Estatal de Conciliación y Arbitraje 

Secretaría de Desarrollo Sustentable

• Procuraduría de Protección al Ambiente del Estado de Morelos

Secretaría de Gobierno

• Instituto Pro-Veteranos de la Revolución del Sur
• Comisión Estatal de Reservas Territoriales
• Instituto de Servicios Registrales y Catastrales
• Instituto de la Mujer para el Estado de Morelos
• Instituto de la Defensoría Pública
• Instituto Morelense de Radio y Televisión

Secretaría de Hacienda

• Instituto de Crédito para los Trabajadores al Servicio del Gobierno del Estado de Morelos (I.C.T.S.G.E.M)

Secretaría de Economía

• Aeropuerto de Cuernavaca S.A de C.V.
• Instituto Morelense para el Financiamiento del Sector Productivo
• Comisión Estatal de Mejora Regulatoría​

Secretaría de Educación

• Colegio de Bachilleres del Estado de Morelos (COBAEM)
• Universidad Politécnica del Estado de Morelos (UPEMOR)
• Colegio de Educación Profesional Técnica de Estado de Morelos (CONALEP)
• Instituto de Educación Básica del Estado de Morelos (IEBEM)
• Instituto de Educación para Adultos (INEEA)
• Colegio de Estudios Científicos y Tecnológicos del Estado de Morelos (CECYTE)
• Universidad Tecnológica Emiliano Zapata (UTEZ)
• Instituto Tecnológico de Zacatepec
• Universidad Tecnológica del Sur del Estado de Morelos 
• Universidad Autónoma del Estado de Morelos
• Instituto Estatal de Infraestructura Educativa

Secretaría de Salud

• Comisión Estatal de Arbitraje Médico
• Hospital del Niño y el Adolescente Morelense
• Servicios de Salud Morelos
• Sistema para el Desarrollo Integral de la Familia del Estado de Morelos (DIF Morelos)
• Centro de Rehabilitación Integral "Xoxotla"

Secretaría de Desarrollo Social 

• Instituto del Deporte

Secretaría del Trabajo

• ​Instituto de Capacitación para el Trabajo del Estado de Morelos (ICATMOR)

Secretaría de Cultura 

• Museo Morelense de Arte Popular 
• Centro Morelense de las Artes del Estado de Morelos 

Secretaría de Desarrollo Sustentable

• Comisión Estatal del Agua 

Secretaría de Innovación, Ciencia y Tecnología 

• ​Consejo de Ciencia y Tecnología del Estado de Morelos

Secretaría de Hacienda

• Fideicomiso de Certificados de Participación Ordinarios (CPO's)

Secretaría de Economía

• Fideicomiso del Fondo de Desarrollo Empresarial y Promoción de la Inversión
• Fideicomiso Ejecutivo del Fondo de Competitividad y Promoción del Empleo

Secretaría de Salud

• Fideicomiso Salud Mental 

Secretaría de Turismo 

• Fideicomiso Lago de Tequesquitengo 
• Fideicomiso Turismo Morelos
• Fideicomiso Balneario Agua Hedionda
• Fideicomisos Centro de Congresos y Convenciones World Trade Center Morelos