La Secretaría de Educación de Morelos tiene sus raíces profundamente ligadas a la evolución educativa de México, particularmente después de los cambios sociales y políticos que trajo la Revolución Mexicana. En ese contexto, el país se embarcó en la construcción de un sistema educativo público que pudiera garantizar el acceso al conocimiento para todos los sectores de la sociedad. En Morelos, como en otros estados, este movimiento fue un catalizador para la creación de instituciones gubernamentales dedicadas exclusivamente a la gestión y supervisión de la educación.

A lo largo de su historia, la Secretaría ha sido una pieza clave en la modernización del sistema educativo en Morelos, promoviendo la mejora continua en infraestructura, calidad académica y acceso equitativo a la educación. Estas acciones han permitido que miles de estudiantes en todo el estado reciban una educación integral y de calidad, preparando a las nuevas generaciones para los retos del futuro.

Con la adopción de la Nueva Escuela Mexicana, la Secretaría ha redoblado sus esfuerzos hacia una educación más inclusiva, centrada en desarrollar competencias académicas y formar estudiantes con valores cívicos y pensamiento crítico. A través de estos esfuerzos, ha consolidado un sistema educativo que respeta la diversidad cultural y social del estado, garantizando que todos los estudiantes tengan la oportunidad de desarrollarse plenamente​.